孢子或花粉的外壁的化石。孢子和花粉的内壁由纤维质构成,易被腐蚀;外壁含接近角质的特种物质(即孢粉素),虽受高温、高压等地质作用的影响,也难以破坏,在地层中往往大量保存。是古孢粉学的主要研究对象。孢粉化石可依据植物系统分类命名,称为自然分类,主要应用于新生代的孢粉分析。若按形态特征命名,称为人为分类,主要应用于古生代和中生代的孢粉分析。