在雌雄同体生物中，同一个体的雌雄配子的结合。在植物方面，指自花授粉和雌雄异花的同株授粉。自交是获得纯系的有效方法。例如，玉米自交系就是通过人工套袋强制自交，连续控制若干代选择培育而成的。对异花授粉植物、常异花授粉植物的连续自交，将导致后代植株生活力的衰退，这是由于基因纯合的结果。
